清热解毒
水飞蓟有清热解毒的功效，全草用于脓肿、丹毒、肝胆湿热、胁痛、黄疸等症。全草外用适量。水飞蓟种子包含叫做水飞蓟素的活性成分，是一种强大的抗氧化剂。它帮助肝脏清除毒素，并且有修复受损肝细胞的功效。
保肝
水飞蓟素为保肝的主要活性成分，具有再生作用，可刺激新的肝细胞形成，改善肝功能； 同时具有肝细胞膜保护作用，预防细胞毒素浸润肝细胞，并提高膜结构缺损的恢复能力。水飞蓟宾能够稳定细胞及细胞内生物膜；可促胆汁分泌；
抗氧化
水飞蓟素的酚羟基提供氢原子而有强大的抗氧化作用。它们具有清除自由基特性,抗脂质过氧化活性。
降血脂
水飞蓟宾能抑制成年大鼠心肌细胞质膜Ca2+通道, 抑制食物诱导的血胆固醇过高,降低极低密度脂蛋白 (VLDL) 与低密度脂蛋白 (LDL), 升高高密度脂蛋白 (HDL), 可用于心血管系统疾病的治疗。
